发布时间：2024-12-03 来源：中税答疑
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一、基本政策规定
二、相关答疑
三、政策变迁
四、税企争议
五、稽查焦点
六、相关案例
七、会计实务
本文主要围绕留抵退税申报中税务机关的审核程序展开探讨，详细阐述了相关的税务基本政策规定，包括基本政策和政策解读，以问答形式呈现的相关答疑，营改增政策前后的变迁对比，税企争议点，稽查焦点以及实际案例，并说明了会计实务中的具体操作。旨在帮助读者全面、深入地了解留抵退税申报过程中税务机关审核程序的各个关键环节及相关要点。
1.基本政策
根据《财政部 税务总局 海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》（财政部 税务总局 海关总署公告 2019 年第 39 号）等文件规定，符合条件的纳税人可向主管税务机关申请留抵退税。税务机关会对纳税人的纳税信用等级、申请退税前 36 个月未发生骗取留抵退税等情形、申请退税前 36 个月未因偷税被税务机关处罚两次及以上等条件进行审核，同时还会关注纳税人的增量留抵税额、进项构成比例等指标是否符合规定。
这些政策旨在确保留抵退税政策的精准实施，防止退税风险，只有符合条件的诚信纳税企业才能享受到留抵退税的优惠，促进企业的健康发展，同时维护税收征管的公平性和严肃性。例如，对纳税信用等级的要求，体现了对纳税人税法遵从度的考量，纳税信用良好的企业更有可能获得退税资格，这也激励企业积极遵守税收法律法规，提高纳税信用等级。
1.税务机关审核留抵退税申请一般需要多长时间 ？
一般情况下，税务机关会在受理留抵退税申请之日起一定时间内完成审核。对于符合条件且无风险疑点的，审核时间相对较短，通常在 10 个工作日左右；若存在风险疑点或需进一步核实的事项，则审核时间会相应延长，具体时间视实际情况而定。
2.如果企业申请留抵退税的资料不齐全，税务机关会如何处理 ？
税务机关会一次性告知企业需要补正的资料内容及期限。企业应在规定期限内补全资料，重新提交申请。若未在规定期限内补正，税务机关将不予受理此次留抵退税申请。
3.企业的留抵税额既有增量又有存量，税务机关如何审核退还顺序 ？
根据相关政策，允许退还的增量留抵税额和存量留抵税额，可按照不同的退税政策分别计算和申请退还。一般先退还增量留抵税额，再根据企业的具体情况和政策规定，审核退还存量留抵税额。
在营改增之前，增值税的抵扣范围相对较窄，留抵税额的处理也较为简单，一般是结转下期继续抵扣，不存在大规模的留抵退税政策。企业的留抵税额主要是由于货物销售等传统增值税应税行为产生的进项税额大于销项税额形成的，这些留抵税额只能在企业后续有足够的销项税额时逐步抵扣，对企业资金的流动性影响相对较小。
营改增全面推开后，增值税的抵扣范围扩大到了更多的行业和业务领域，企业的进项税额构成更加复杂，留抵税额的规模也有所增加。为了减轻企业负担，优化营商环境，国家陆续出台了一系列留抵退税政策，从部分行业的试点到全行业逐步推开，退税条件、计算方法等也不断细化和完善，使更多符合条件的企业能够享受到留抵退税带来的资金红利，有力地支持了企业的发展。
争议点一：企业对税务机关认定的行业归属存在异议。例如，某企业认为自身应属于享受留抵退税政策的特定行业，但税务机关根据其实际经营业务和相关标准，判定其不属于该行业。这可能导致企业无法享受相应的留抵退税政策，从而引发争议。
争议点二：对于进项构成比例的计算和确认，企业与税务机关可能存在不同理解。企业可能认为某些特殊的进项税额应纳入计算范围，而税务机关依据政策规定予以排除，双方意见不一致，进而产生争议。
争议点三：在风险疑点的排查和处理过程中，企业可能认为税务机关对某些疑点的认定过于严格或不准确，导致退税申请被暂停或驳回，影响企业的资金安排和正常经营，从而引发税企之间的争议。
1.发票的真实性和合法性。税务机关会重点稽查企业用于申请留抵退税的进项发票是否真实有效，是否存在虚开发票、伪造发票等违法行为。一旦发现发票存在问题，不仅退税申请会被驳回，企业还将面临严厉的税务处罚。
2.业务的真实性。稽查人员会审查企业的经营业务是否真实发生，是否存在虚构交易、骗取留抵退税的情况。例如，通过核对合同、物流信息、资金流等资料，核实企业的采购、销售等业务是否与申报的留抵税额相符。
3.数据的准确性。税务机关会对企业申报的留抵退税数据进行严格审核，包括进项税额、销项税额、留抵税额等各项数据的计算是否准确，是否存在人为调整数据以满足退税条件的情况。
案例一：某制造企业 A 申请留抵退税，税务机关在审核过程中发现其提供的部分进项发票存在异常，经进一步调查核实，这些发票系企业从非法渠道取得的虚开发票。最终，税务机关不仅驳回了企业的退税申请，还依法对企业进行了处罚，要求企业补缴相应的税款和滞纳金，并追究相关人员的法律责任。
案例二：企业 B 属于符合留抵退税条件的小微企业，但其在申报时对进项构成比例的计算出现错误，导致多申报了可退还的留抵税额。税务机关在审核中发现了这一问题，要求企业重新准确计算并调整申报数据，按照正确的金额办理留抵退税手续。
案例三：企业 C 在申请留抵退税后，税务机关在后续的稽查中发现其存在虚构销售业务的情况，通过伪造销售合同和相关凭证，虚增了销项税额，从而使留抵税额看起来符合退税条件。税务机关依法追缴了已退税款，并对企业处以重罚，同时将该案件移送司法机关处理，企业负责人也面临刑事处罚。
1.具体操作步骤
企业在申请留抵退税时，首先应根据税务机关的要求，准确填写《退抵税费申请（增值税制度性留抵退税）》等相关申请表，如实填报企业的基本信息、退税企业类型、申请退还项目、营业收入、资产总额、企业划型等内容，并对所填报信息的真实性和准确性负责。
税务机关审核通过后，企业在收到留抵退税款时，应进行如下会计处理：借记 “银行存款” 科目，贷记 “应交税费 —— 应交增值税（进项税额转出）” 科目。这样的处理反映了企业的留抵税额得到了实际退还，同时将相应的进项税额转出，避免了重复抵扣。
企业应建立健全的会计核算制度，准确记录和核算增值税的进项税额、销项税额等相关数据，确保留抵退税申报数据的真实性和准确性。
在留抵退税申请过程中，企业应积极配合税务机关的审核工作，及时提供所需的资料和信息，如有疑问或不确定的事项，应及时与税务机关沟通咨询，避免因误解或操作不当而影响退税申请的审批进度和结果。
留抵退税政策是国家为了支持企业发展、减轻企业负担而实施的一项重要税收优惠政策。税务机关的审核程序是确保该政策准确、公平实施的关键环节。企业在申请留抵退税时，应深入了解相关政策规定，严格按照要求准备和提交申报资料，积极配合税务机关的审核工作，确保退税申请的合法合规。同时，税务机关也应不断加强审核管理，防范退税风险，提高审核效率，使留抵退税政策更好地服务于经济社会的发展，促进企业的转型升级和可持续发展。
